月見団子は15個を三方に積みます（9 + 4 + 2）。 球を15個並べて終わり、にはなりません。月見団子.js の冒頭にこうあります。

平らにするだけなら簡単です。接触面の側を切り落とせばよい。 ところが、それだけではやせた球になります。餅は非圧縮なので、 押されて減った体積はどこかへ行かなければいけません。 行き先は、押されていない自由な面です。つまり他の方向がその分ふくらむ。

// 方向ごとの半径を smin で丸める（＝縁に土手のある柔らかい接触）
let r = R;
for (const c of contacts) {
    const d = dot(dir, c.n);
    if (d > 0) r = smin(r, c.dist / d, R * 0.090);  // なめらかな最小値
}
// 切り取った球冠の体積ぶんだけ全体を膨らませる（餅は非圧縮）
r *= Math.cbrt(1 + volumeLoss / sphereVolume);

なめらかな最小値（smin）

接触面を作るには「球の半径」と「接触面までの距離」の小さいほうを取ればよい。 ただし Math.min をそのまま使うと、境目に鋭い角ができます。 実物の団子には角がありません。わずかに丸い土手ができて、そこに細い影の線が入ります。

// 多項式スムーズ最小値。k のぶんだけ、境目が丸くつながる
const smin = (a, b, k) => {
    const h = Math.max(0, k - Math.abs(a - b)) / k;
    return Math.min(a, b) - h * h * k * 0.25;
};

串は、団子の中心を通っていない

花見団子は同じ問題を、別の向きで扱っています。 串の方向に押しつぶされ、隣と接する両端が平らになる。 直径 3.0cm に対して串方向は約 2.4cm、接触面の直径は約 1.2cm。 さらに、

• 串の入口は生地が引き込まれてすり鉢状にへこむ（平らだと刺さって見えない）
• 団子は串の中心に乗っていない。わずかに偏心している
• 隣どうしは「めり込む」のではなく、平らな面が触れて細い影の線ができる

どれも数ミリの話です。ところが、この数ミリを入れるかどうかで、 「色つきの球に棒」か「団子」かが決まります。